Организация должна производить расчет заработной платы за период нахождения работника в командировке исходя из средней заработной платы, которая в соответствии со ст. 255 Налогового кодекса Российской Федерации учитывается в расходах на оплату труда.
Об этом - письмо Минфина РФ от 09.07.2007 N 03-03-06/2/121
Согласно ст. 167 Трудового кодекса Российской Федерации (далее - ТК РФ) при направлении работника в служебную командировку ему гарантируется сохранение места работы и среднего заработка, а также возмещение расходов, связанных со служебной командировкой.
Исчисление среднего заработка регулируется ст. 139 ТК РФ и Положением об особенностях порядка исчисления средней заработной платы, утвержденным Постановлением Правительства Российской Федерации от 11.04.2003 N 213.
В соответствии с указанными нормативными документами расчет средней заработной платы работника за время командировки производится исходя из фактически начисленной ему заработной платы и фактически отработанного им времени за 12 календарных месяцев, предшествующих моменту выплаты.