В настоящее время обособленные подразделения (филиалы, представительства и др.) плательщиками НДС не являются. Плательщиками НДС признаются создавшие их организации, которые уплачивают НДС по месту постановки их на учет без распределения налога по обособленным подразделениям.
Налоговые декларации по НДС представляются в налоговый орган по месту налогового учета головной организации.
Об этом - письмо УФНС РФ по г. Москве от 27.03.2007 N 19-11/028237
В соответствии со ст. 143 НК РФ плательщиками НДС признаются организации, индивидуальные предприниматели, лица, признаваемые налогоплательщиками НДС в связи с перемещением товаров через таможенную границу РФ, определяемые на основании Таможенного кодекса РФ.
Согласно п. 2 ст. 11 НК РФ под организациями понимаются юридические лица, образованные в соответствии с законодательством РФ, а также иностранные юридические лица, компании и другие корпоративные образования, обладающие гражданской правоспособностью, созданные на основании законодательства иностранных государств, международные организации, их филиалы и представительства, созданные на территории РФ.
Таким образом, обязанность по уплате НДС возложена только на организации и индивидуальных предпринимателей.
Кроме того, п. 23 ст. 1 Федерального закона от 29.05.2002 N 57-ФЗ ''О внесении изменений и дополнений в часть вторую НК РФ и в отдельные законодательные акты РФ'' из Налогового кодекса РФ исключена ст. 175 НК РФ. Согласно данной статье организация, в состав которой входят обособленные подразделения, уплачивает НДС как по месту своего нахождения, так и по месту нахождения каждого из обособленных подразделений.